パッケージ: python3-cogent3 (2024.5.7a1+dfsg-3 など)

[ ソース: python-cogent  ]

framework for genomic biology

PyCogent is a software library for genomic biology. It is a fully integrated and thoroughly tested framework for:

 * controlling third-party applications,
 * devising workflows; querying databases,
 * conducting novel probabilistic analyses of biological sequence
   evolution, and
 * generating publication quality graphics.

It is distinguished by many unique built-in capabilities (such as true codon alignment) and the frequent addition of entirely new methods for the analysis of genomic data.

その他の python3-cogent3 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• dep: python3 [ppc64 以外]

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.10) [m68k]

  dep: python3 (<< 3.9) [alpha, riscv64, x32]

  dep: python3 (>= 3.8~) [alpha, m68k, riscv64, x32]

• dep: python3-chardet [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, s390x]

  Universal Character Encoding Detector (Python3)

• dep: python3-matplotlib

  Python based plotting system in a style similar to Matlab

• dep: python3-numba [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, s390x]

  native machine code compiler for Python 3

• dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [alpha, m68k, ppc64, riscv64, x32]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [s390x]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

• dep: python3-numpy-abi9

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy

• dep: python3-pandas

  data structures for "relational" or "labeled" data

• dep: python3-plotly

  Python 3 plotting library for publication-quality graphs

• dep: python3-scipy [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, s390x]

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-scitrack

  Python3 library to track scientific data

• dep: python3-stevedore [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  manage dynamic plugins for Python applications - python3

• dep: python3-tinydb

  document oriented database optimized

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• dep: python3-typing-extensions [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, s390x]

  Backported and Experimental Type Hints for Python

• rec: dialign

  Segment-based multiple sequence alignment

• rec: ncbi-blast+-legacy

  NCBI Blast legacy call script

• sug: python-cogent-doc

  docs for python3-cogent3

python3-cogent3 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2020.2.7a+dfsg-2	1,480.1 kB	5,864.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2024.5.7a1+dfsg-3	1,954.9 kB	7,005.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2024.5.7a1+dfsg-3	1,954.9 kB	7,005.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2020.2.7a+dfsg-2+b1	1,398.3 kB	5,074.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2024.5.7a1+dfsg-3	1,613.4 kB	4,381.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2020.6.30a0+dfsg-1	779.8 kB	1,447.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2024.5.7a1+dfsg-3	1,954.9 kB	7,005.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64 (非公式の移植版)	2020.2.7a+dfsg-2+b1	1,485.7 kB	5,526.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2023.12.15a1+dfsg-1	1,592.0 kB	4,290.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2020.2.7a+dfsg-2	1,501.1 kB	5,670.0 kB	[ファイル一覧]