パッケージ: coot (1.1.09+dfsg-4)

[ ソース: coot  ]

model building program for macromolecular crystallography

This is a program for constructing atomic models of macromolecules from x-ray diffraction data. Coot displays electron density maps and molecular models and allows model manipulations such as idealization, refinement, manual rotation/translation, rigid-body fitting, ligand search, solvation, mutations, rotamers. Validation tools such as Ramachandran and geometry plots are available to the user. This package provides a Coot build with embedded Python support.

その他の coot 関連パッケージ

• dep: coot-data

  various data files needed by Coot

• dep: gir1.2-gtk-4.0

  GTK グラフィカルユーザインターフェースライブラリ -- gir バインディング

• dep: libasound2t64 (>= 1.0.16)

  ALSA アプリケーション用の共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: liboss4-salsa-asound2

• dep: libblas3

  基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Python Library

• dep: libboost-python1.83.0-py312

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-python1.83.0

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.6.0)

  Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libcootapi1.1 (>= 1.1.09+dfsg)

  shared library for coot

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2)

  使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (GnuTLS フレーバ)

• dep: libepoxy0 (>= 1.3)

  OpenGL 関数ポインタ管理ライブラリ

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  FreeType 2 フォントエンジン共有ライブラリファイル

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0)

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

  GDK Pixbuf ライブラリ

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.80.0)

  C ルーチンの GLib ライブラリ

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: libgraphene-1.0-0 (>= 1.5.4)

  library of graphic data types

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgtk-4-1 (>= 4.12.0)

  GTK グラフィカルユーザインターフェースライブラリ

• dep: libmmdb2-0 (>= 2.0.22)

  macromolecular coordinate library - runtime

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  国際化されたテキストのレイアウトと描画

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  国際化されたテキストのレイアウトと描画

• dep: libpng16-16t64 (>= 1.6.2)

  PNG ライブラリ - ランタイム (バージョン 1.6)

• dep: libpython3.13 (>= 3.13.0~rc3)

  Shared Python runtime library (version 3.13)

• dep: librdkit1t64 (>= 202409.4)

  Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 共有ライブラリ

• dep: libssm2 (>= 1.4.0)

  macromolecular superposition library - runtime

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libvorbisfile3 (>= 1.1.2)

  Vorbis 汎用オーディオ圧縮コーデック用高レベル API

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-gi

  gobject-introspection ライブラリ向け Python 3 用バインディング

• dep: python3-rdkit

  Collection of cheminformatics and machine-learning software

• dep: refmac-dictionary

  dictionary for macromolecular refinement and model building

• dep: sfftw2 (>= 2.1.5)

  library for computing Fast Fourier Transforms

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• sug: coot-doc

  documentation for Coot

coot のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
ppc64el	8,590.5 kB	37,168.0 kB	[ファイル一覧]