パッケージ: r-bioc-variantannotation (1.50.0-1) [debports]
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- ホームページ [bioconductor.org]
類似のパッケージ:
BioConductor annotation of genetic variants
This BioConductor package provides R functions to annotate variants, compute amino acid coding changess and to predict coding outcomes.
その他の r-bioc-variantannotation 関連パッケージ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
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- dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0)
- 使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (OpenSSL フレーバ)
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- dep: r-api-4.0
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.19
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0)
- GNU R Annotation Database Interface for BioConductor
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- dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0)
- base functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)
- GNU R string objects representing biological sequences
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- dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.72.0)
- BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
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- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
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- dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
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- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
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- dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
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- dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.16.0)
- S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects
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- dep: r-bioc-rhtslib (>= 3.0.0)
- HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
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- dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
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- dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.64.0)
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)
- BioConductor assay container
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- dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
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- dep: r-bioc-zlibbioc (>= 1.50.0)
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- dep: r-cran-dbi
- GNU R package providing a generic database interface
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- sug: r-bioc-annotationhub (>= 3.12.0)
- GNU R client to access AnnotationHub resources
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- sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-snpstats (>= 1.54.0)
- BioConductor SnpMatrix and XSnpMatrix classes and methods
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- sug: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
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- sug: r-cran-httr
- GNU R tools for working with URLs and HTTP
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- sug: r-cran-jsonlite
- Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-magick
- advanced graphics and image-processing in GNU R
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- sug: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework