パッケージ: r-bioc-edger (4.0.16+dfsg-1) [debports]
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外部の資源:
- ホームページ [bioconductor.org]
類似のパッケージ:
Empirical analysis of digital gene expression data in R
Bioconductor package for differential expression analysis of whole transcriptome sequencing (RNA-seq) and digital gene expression profiles with biological replication. It uses empirical Bayes estimation and exact tests based on the negative binomial distribution. It is also useful for differential signal analysis with other types of genome-scale count data.
その他の r-bioc-edger 関連パッケージ
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- dep: libblas3
- 基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ
- または libblas.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: liblapack3
- 線形代数ルーチンライブラリ 3 - 共有ライブラリ版
- または liblapack.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: r-api-4.0
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.18
- パッケージは利用できません
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- dep: r-bioc-limma (>= 3.41.5)
- linear models for microarray data
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- dep: r-cran-locfit
- GNU R local regression, likelihood and density estimation
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- dep: r-cran-rcpp
- GNU R package for Seamless R and C++ Integration
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- sug: r-bioc-annotationdbi
- GNU R Annotation Database Interface for BioConductor
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- sug: r-bioc-biobase
- base functions for Bioconductor
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- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-org.hs.eg.db
- genome-wide annotation for Human
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- sug: r-bioc-rhdf5
- BioConductor HDF5 interface to R
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- sug: r-bioc-summarizedexperiment
- BioConductor assay container
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- sug: r-cran-jsonlite
- Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R
-
- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-matrix
- GNU R package of classes for dense and sparse matrices
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- sug: r-cran-readr
- GNU R package to read rectangular text data
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- sug: r-cran-seuratobject
- GNU R data structures for single cell data