パッケージ: circlator (1.5.6-12)

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ホームページ [sanger-pathogens.github.io]

類似のパッケージ:

ゲノムアセンブリの環状化

Circlator は、バクテリアや小さな真核生物のゲノム用のアセンブリ環状化ツールで、環状配列の正確な線形表現を生成できます。

タグ: 生物学: 核酸, 分野: 生物学, field::biology:bioinformatics, implemented-in::python, 役割: プログラム, 科学: science::calculation, works-with::biological-sequence, 取り扱い対象: ファイル

その他の circlator 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
dep: canu

一分子シークエンスゲノムアセンブラ
dep: fastaq

FASTA and FASTQ file manipulation tools
dep: mummer

遺伝子全体の効率的な配列アライメント
dep: prodigal

Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-openpyxl

Python 3 module to read/write OpenXML xlsx/xlsm files
dep: python3-packaging

core utilities for python3 packages
dep: python3-pymummer

Python 3 interface to MUMmer
dep: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

rec: spades

genome assembler for single-cell and isolates data sets

circlator のダウンロード

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アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
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