パッケージ: python3-cyvcf2 (0.30.28-1 など) [debports]
python3-cyvcf2 に関するリンク
Debian の資源:
ソースパッケージをダウンロード:
見つかりませんメンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
その他の python3-cyvcf2 関連パッケージ
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- dep: libc6.1 (>= 2.37)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.13)
- dep: python3 (>= 3.11~)
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- dep: python3-click
- Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x
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- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
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- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
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- dep: python3-numpy-abi9
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy