パッケージ: tantan (51-1)

[ ソース: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, works-with::biological-sequence

その他の tantan 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

tantan のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
armel	36.9 kB	107.0 kB	[ファイル一覧]