[ ソース: seqan-raptor ]
パッケージ: seqan-raptor (3.0.1+ds-5 など)
seqan-raptor に関するリンク
Debian の資源:
seqan-raptor ソースパッケージをダウンロード:
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.dsc]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
その他の seqan-raptor 関連パッケージ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0)
- YAML parser and emitter for C++
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- sug: cwl-runner
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: cwltool, toil