パッケージ: r-bioc-glmgampoi (1.16.0+dfsg-1)

[ ソース: r-bioc-glmgampoi  ]

GNU R fit a Gamma-Poisson generalized linear model

Fit linear models to overdispersed count data. The package can estimate the overdispersion and fit repeated models for matrix input. It is designed to handle large input datasets as they typically occur in single cell RNA-seq experiments.

その他の r-bioc-glmgampoi 関連パッケージ

• dep: libblas3

  基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC 共有ライブラリ

• dep: liblapack3

  線形代数ルーチンライブラリ 3 - 共有ライブラリ版

  または liblapack.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: r-api-4.0

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-beachmat (>= 2.20.0)

  I/O for several formats storing matrix data

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.30.1)

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats (>= 1.26.0)

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• dep: r-bioc-hdf5array (>= 1.32.0)

  HDF5 backend for DelayedArray objects

• dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.16.0)

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-singlecellexperiment (>= 1.26.0)

  S4 Classes for Single Cell Data

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor assay container

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rcpparmadillo

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• dep: r-cran-rlang

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• dep: r-cran-vctrs

  GNU R vector helpers

• sug: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.44.0)

  R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

• sug: r-bioc-edger (>= 4.2.1)

  Empirical analysis of digital gene expression data in R

• sug: r-bioc-limma (>= 3.60.4)

  linear models for microarray data

• sug: r-bioc-scran (>= 1.32.0)

  BioConductor methods for single-cell RNA-Seq data analysis

• sug: r-cran-bench

  High Precision Timing of R Expressions

• sug: r-cran-dplyr

  GNU R grammar of data manipulation

• sug: r-cran-ggplot2

  implementation of the Grammar of Graphics

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-mass

  GNU R package of Venables and Ripley's MASS

• sug: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-statmod

  GNU R package providing algorithms and functions for statistical modeling

• sug: r-cran-testthat (>= 2.1.0)

  GNU R testsuite

• sug: r-cran-zoo

  GNU R package for totally ordered indexed observations

r-bioc-glmgampoi のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1,241.8 kB	2,374.0 kB	[ファイル一覧]