[ ソース: megahit ]
パッケージ: megahit (1.2.9-5)
ultra-fast and memory-efficient meta-genome assembler
Megahit is an ultra-fast and memory-efficient NGS assembler. It is optimized for metagenomes, but also works well on generic single genome assembly (small or mammalian size) and single-cell assembly.
The software was praised in a Briefings in Bioinformatics 5/2020 review (DOI: 10.1093/bib/bbaa085).
その他の megahit 関連パッケージ
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- dep: bzip2
- 高品質ブロックソートファイル圧縮 - ユーティリティ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- dep: python3-all
- package depending on all supported Python 3 runtime versions
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム