パッケージ: altree (1.3.2-2 など)

[ ソース: altree  ]

program to perform phylogeny-based association and localization analysis

ALTree was designed to perform association detection and localization of susceptibility sites using haplotype phylogenetic trees: first, it allows the detection of an association between a candidate gene and a disease, and second, it enables to make hypothesis about the susceptibility loci.

タグ: ソフトウェア開発: Perl での開発, ライブラリ, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: C, implemented-in::perl, interface::commandline, 役割: 開発ライブラリ, role::program, role::shared-lib, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: 解析, use::comparing, works-with-format::TODO, サポート形式: プレーンテキスト, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の altree 関連パッケージ

• dep: libblas3

  基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, loong64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [ia64 以外]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libmath-tamuanova-perl

  Perl extension for the tamuanova library

• dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [ia64]

  Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語

  dep: perl (>= 5.40.0-6) [hppa, ia64 以外]

  dep: perl (>= 5.40.1-2) [hppa]

• dep: perlapi-5.38.2 [ia64]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: perl-base

• dep: perlapi-5.40.0 [hppa, ia64 以外]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: perl-base

• dep: perlapi-5.40.1 [hppa]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: perl-base

• rec: libopenblas0

  Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)

  または libblis4

  BLAS-like Library Instantiation Software Framework (32bit,meta)

  または libmkl-rt

  Intel® MKL: Single Dynamic Library (SDL)

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• sug: altree-examples

  example files for ALTree

altree のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.3.2-2+b4	337.3 kB	570.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.3.2-2+b4	337.6 kB	562.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.3.2-2+b4	338.0 kB	570.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.3.2-2+b4	336.8 kB	561.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.3.2-2+b4	333.5 kB	541.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.3.2-2+b5	338.6 kB	573.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.3.2-2+b4	337.5 kB	565.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.3.2-2+b2	345.3 kB	621.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	1.3.2-2+b4	339.0 kB	570.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.3.2-2+b4	333.1 kB	553.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.3.2-2+b4	337.6 kB	573.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.3.2-2+b4	340.4 kB	635.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.3.2-2+b4	339.8 kB	634.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.3.2-2+b5	339.6 kB	554.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.3.2-2+b4	338.0 kB	566.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.3.2-2+b4	338.5 kB	569.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.3.2-2+b4	334.3 kB	1,532.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.3.2-2+b4	337.0 kB	561.0 kB	[ファイル一覧]