パッケージ: gromacs (2025.0~beta-1)

[ ソース: gromacs  ]

試験的な (experimental の) パッケージ

警告: このパッケージは experimental ディストリビューションのものです。つまり、おそらく不安定でバグがあり、それどころかデータの損失を起こすかもしれません。使用前には、変更履歴やその他の参照可能なドキュメントを必ず調べてください。

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains variants both for execution on a single machine, and using the MPI interface across multiple machines.

タグ: 分野: 生物学, 構造生物学, field::chemistry, implemented-in::c, ユーザインタフェース: コマンドライン, interface::graphical, interface::x11, 役割: プログラム, インタフェースツールキット: X ライブラリ, X ウィンドウシステム: アプリケーション

その他の gromacs 関連パッケージ

• dep: gromacs-data (= 2025.0~beta-1)

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgromacs10 (>= 2025.0~beta)

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• rec: cpp

  GNU C プリプロセッサ (cpp)

• rec: mpi-default-bin

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• sug: pymol

  Molecular Graphics System

gromacs のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
ppc64el	62.3 kB	589.0 kB	[ファイル一覧]