[ ソース: scoary ]
パッケージ: scoary (1.6.16-1)
pangenome-wide association studies
Scoary is designed to take the gene_presence_absence.csv file from Roary as well as a traits file created by the user and calculate the associations between all genes in the accessory genome and the traits. It reports a list of genes sorted by strength of association per trait.
その他の scoary 関連パッケージ
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- dep: python
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (Python2 バージョン)
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- dep: python (>= 2.7)
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (Python2 バージョン)
- または python-argparse
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libpython2.7-stdlib
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- dep: python-pkg-resources
- pkg_resources を用いたパッケージ検索およびリソースアクセス
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- dep: python-scipy
- scientific tools for Python
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- sug: roary
- high speed stand alone pan genome pipeline