[ ソース: bio-eagle ]
パッケージ: bio-eagle (2.4.1-1)
bio-eagle に関するリンク
Debian の資源:
bio-eagle ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [data.broadinstitute.org]
類似のパッケージ:
Haplotype phasing within a genotyped cohort or using a phased reference panel
Eagle estimates haplotype phase either within a genotyped cohort or using a phased reference panel. The basic idea of the Eagle1 algorithm is to harness identity-by-descent among distant relatives—which is pervasive at very large sample sizes but rare among smaller numbers of samples—to rapidly call phase using a fast scoring approach. In contrast, the Eagle2 algorithm analyzes a full probabilistic model similar to the diploid Li-Stephens model used by previous HMM-based methods.
Please note: The executable was renamed to bio-eagle because of a name clash. Please read more about this in /usr/share/doc/bio-eagle/README.Debian.
その他の bio-eagle 関連パッケージ
|
|
|
|
-
- dep: libboost-iostreams1.67.0
- Boost.Iostreams ライブラリ
-
- dep: libboost-program-options1.67.0
- C++ 用プログラムオプションライブラリ
-
- dep: libc6 (>= 2.27)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC 共有ライブラリ
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
-
- dep: libhts2 (>= 1.4.1)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libopenblas-base
- Optimized BLAS (linear algebra) library (shared library)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
-
- rec: med-config (>= 2.1)
- Debian Med general config package
-
- sug: bio-eagle-examples
- Examples for bio-eagle