パッケージ: maq (0.7.1-8)

[ ソース: maq  ]

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, implemented-in::perl, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: role::program, scope::utility, 目的: 追加のタグが必要, 解析, use::comparing, use::searching, サポート形式: 追加のタグが必要, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

その他の maq 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.5)

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

maq のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
armhf	302.6 kB	492.0 kB	[ファイル一覧]