パッケージ: clustalw (2.1+lgpl-6)
clustalw に関するリンク
Debian の資源:
clustalw ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Steffen Moeller (QA ページ)
- Charles Plessy (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [www.clustal.org]
類似のパッケージ:
global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
This program performs an alignment of multiple nucleotide or amino acid sequences. It recognizes the format of input sequences and whether the sequences are nucleic acid (DNA/RNA) or amino acid (proteins). The output format may be selected from in various formats for multiple alignments such as Phylip or FASTA. Clustal W is very well accepted.
The output of Clustal W can be edited manually but preferably with an alignment editor like SeaView or within its companion Clustal X. When building a model from your alignment, this can be applied for improved database searches. The Debian package hmmer creates such in form of an HMM.
その他の clustalw 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.5)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- sug: clustalx
- Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)
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- sug: seaview
- Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
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- enh: bioperl-run
- BioPerl wrappers: scripts
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- enh: emboss
- ヨーロッパ分子生物学オープンソフトウェアスイート
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- enh: t-coffee
- Multiple Sequence Alignment