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アダプティブポアソンボルツマンソルバ

APBS は、海水中の分子溶質間の静電的な相互作用を記述するための最も有名な 連続体モデルの一つであるポアソン-ボルツマン方程式 (PBE) の数値解析用 ソフトウェアパッケージです。 連続体における静電気は、以下に示す生物分子シミュレーションに関する いくつかの分野において、重要な役目を負っています。

 * 配列子-蛋白質間と蛋白質-蛋白質間の拘束運動学の決定用拡散過程の
   シミュレーション、
 * 生物分子の分子運動学の厳密解、
 * 配列子-蛋白質間と蛋白質-蛋白質間の平衡結合定数の決定のための
   解法および結合エネルギー計算並びに合理的な製薬設計の補助、
 * そして生物分子滴定法の研究。

APBS は、何千個もの原子を持つ分子の調査を可能とする幅広い範囲の シミュレーションのため、効率的に静電気特性を評価するために 設計されました。

タグ: 分野: 化学, 実装言語: C, ユーザインタフェース: interface::commandline, role::program, 対象範囲: ユーティリティ

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