パッケージ: embassy-domalign (0.1.660-4)

[ ソース: embassy-domalign  ]

Extra EMBOSS commands for protein domain alignment

The DOMALIGN programs were developed by Jon Ison and colleagues at MRC HGMP for their protein domain research. They are included as an EMBASSY package as a work in progress.

Applications in the current domalign release are allversusall (sequence similarity data from all-versus-all comparison), domainalign (generates alignments (DAF file) for nodes in a DCF file), domainrep (reorders DCF file to identify representative structures) and seqalign (extend alignments (DAF file) with sequences (DHF file)).

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, アプリケーションスイート: suite::TODO, use::analysing, 目的: 比較, 編集, サポート形式: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の embassy-domalign 関連パッケージ

• dep: emboss-lib (<< 6.6.1~)

  EMBOSS ライブラリ

  dep: emboss-lib (>= 6.6.0+dfsg)

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libx11-6

  X11 クライアントサイドライブラリ

• rec: emboss

  ヨーロッパ分子生物学オープンソフトウェアスイート

• sug: embassy

  パッケージは利用できません

embassy-domalign のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
s390x	65.6 kB	605.0 kB	[ファイル一覧]