[ ソース: bali-phy ]
パッケージ: bali-phy (3.6.0+dfsg-1)
bali-phy に関するリンク
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メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www.bali-phy.org]
類似のパッケージ:
Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny
BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.
BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.
その他の bali-phy 関連パッケージ
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- dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0)
- 時間、時刻、クロックの C++ 表現
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- dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)
- C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
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- dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)
- C++ 用プログラムオプションライブラリ
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- dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0)
- Boost 乱数ライブラリ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcairo2 (>= 1.4.10)
- Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
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- rec: gnuplot
- Command-line driven interactive plotting program.
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
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- rec: r-base
- GNU R 統計計算・グラフィックスシステム