[ ソース: r-bioc-deseq2 ]
パッケージ: r-bioc-deseq2 (1.30.1+dfsg-1)
r-bioc-deseq2 に関するリンク
Debian の資源:
r-bioc-deseq2 ソースパッケージをダウンロード:
- [r-bioc-deseq2_1.30.1+dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-deseq2_1.30.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-deseq2_1.30.1+dfsg-1.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [bioconductor.org]
類似のパッケージ:
R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
Differential gene expression analysis based on the negative binomial distribution. Estimate variance-mean dependence in count data from high-throughput sequencing assays and test for differential expression based on a model using the negative binomial distribution.
その他の r-bioc-deseq2 関連パッケージ
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- dep: libblas3
- 基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ
- または libblas.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: liblapack3
- 線形代数ルーチンライブラリ 3 - 共有ライブラリ版
- または liblapack.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: r-api-4.0
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.12
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-base-core (>= 4.0.4-1)
- GNU R core of statistical computation and graphics system
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- dep: r-bioc-biobase
- base functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.7.5)
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocparallel
- BioConductor facilities for parallel evaluation
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- dep: r-bioc-genefilter
- methods for filtering genes from microarray experiments
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- dep: r-bioc-geneplotter
- R package of functions for plotting genomic data
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- dep: r-bioc-genomicranges
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
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- dep: r-bioc-iranges
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.1.6)
- BioConductor assay container
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- dep: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
-
- dep: r-cran-locfit
- GNU R local regression, likelihood and density estimation
-
- dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)
- GNU R package for Seamless R and C++ Integration
-
- dep: r-cran-rcpparmadillo
- GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library
-
- rec: r-bioc-glmgampoi
- GNU R fit a Gamma-Poisson generalized linear model
-
- rec: r-bioc-tximport
- transcript-level estimates for biological sequencing
-
- rec: r-cran-testthat
- GNU R testsuite
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- sug: r-cran-biocmanager
- access the Bioconductor project package repository
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-pbapply
- GNU R package providing progress bars for vectorized R functions
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- sug: r-cran-pheatmap
- GNU R package to create pretty heatmaps
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- convert R markdown documents into a variety of formats