[ ソース: kmer ]
パッケージ: meryl (0~20150903+r2013-8 など)
meryl に関するリンク
Debian の資源:
kmer ソースパッケージをダウンロード:
- [kmer_0~20150903+r2013-8.dsc]
- [kmer_0~20150903+r2013.orig.tar.gz]
- [kmer_0~20150903+r2013-8.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [kmer.sourceforge.net]
類似のパッケージ:
in- and out-of-core kmer counting and utilities
meryl computes the kmer content of genomic sequences. Kmer content is represented as a list of kmers and the number of times each occurs in the input sequences. The kmer can be restricted to only the forward kmer, only the reverse kmer, or the canonical kmer (lexicographically smaller of the forward and reverse kmer at each location). Meryl can report the histogram of counts, the list of kmers and their counts, or can perform mathematical and set operations on the processed data files.
This package is part of the Kmer suite.
その他の meryl 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.19)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- sug: gridengine-client
- Utilities for Grid Engine queue management