[ ソース: libssw ]
パッケージ: ssw-align (1.1-13)
Smith-Waterman aligner based on libssw
This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.
その他の ssw-align 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libssw0 (= 1.1-13)
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム