[ ソース: pairtools ]
パッケージ: python3-pairtools (0.3.0-2 など)
python3-pairtools に関するリンク
Debian の資源:
pairtools ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment
Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.
Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:
- Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
sequences of Hi-C DNA molecules
- Sort .pairs files for downstream analyses
- Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
- Generate extensive statistics of Hi-C datasets
- Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
- Restore .sam alignments from Hi-C pairs
その他の python3-pairtools 関連パッケージ
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- dep: cython3
- C-Extensions for Python 3
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- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
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- dep: python3-click
- Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
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- dep: python3-nose
- test discovery and running for Python3 unittest
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- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language