[ ソース: lighter ]
パッケージ: lighter (1.1.2-5)
lighter に関するリンク
Debian の資源:
lighter ソースパッケージをダウンロード:
- [lighter_1.1.2-5.dsc]
- [lighter_1.1.2.orig-debian-tests-data.tar.gz]
- [lighter_1.1.2.orig.tar.gz]
- [lighter_1.1.2-5.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
fast and memory-efficient sequencing error corrector
Lighter is a fast, memory-efficient tool for correcting sequencing errors. Lighter avoids counting k-mers. Instead, it uses a pair of Bloom filters, one holding a sample of the input k-mers and the other holding k-mers likely to be correct. As long as the sampling fraction is adjusted in inverse proportion to the depth of sequencing, Bloom filter size can be held constant while maintaining near-constant accuracy. Lighter is parallelized, uses no secondary storage, and is both faster and more memory-efficient than competing approaches while achieving comparable accuracy.
その他の lighter 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム