パッケージ: r-bioc-dnacopy (1.64.0-1)
r-bioc-dnacopy に関するリンク
Debian の資源:
r-bioc-dnacopy ソースパッケージをダウンロード:
- [r-bioc-dnacopy_1.64.0-1.dsc]
- [r-bioc-dnacopy_1.64.0.orig.tar.gz]
- [r-bioc-dnacopy_1.64.0-1.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www.bioconductor.org]
類似のパッケージ:
R package: DNA copy number data analysis
Implements the circular binary segmentation (CBS) algorithm to segment DNA copy number data and identify genomic regions with abnormal copy number.
This package is for analyzing array DNA copy number data, which is usually (but not always) called array Comparative Genomic Hybridization (array CGH) data It implements a methodology for finding change-points in these data which are points after which the (log) test over reference ratios have changed location. This model is that the change-points correspond to positions where the underlying DNA copy number has changed. Therefore, change-points can be used to identify regions of gained and lost copy number. Also provided is a function for making relevant plots of these data.
その他の r-bioc-dnacopy 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgfortran5 (>= 10)
- GNU Fortran アプリケーション用ランタイムライブラリ
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- dep: r-api-4.0
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.12
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)
- GNU R core of statistical computation and graphics system