[ ソース: tombo ]
パッケージ: tombo (1.5.1-2 など)
identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data
Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.
その他の tombo 関連パッケージ
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- dep: cython3
- C-Extensions for Python 3
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
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- dep: python3-h5py
- general-purpose Python interface to hdf5
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- dep: python3-h5py-serial
- general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)
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- dep: python3-mappy
- Python3 interface minimap2
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- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
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- dep: python3-pkg-resources
- pkg_resources を用いたパッケージ検索およびリソースアクセス
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- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
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- dep: python3-tqdm
- fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool
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- rec: python3-pyfaidx
- efficient random access to fasta subsequences for Python 3
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- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: python3-rpy2