パッケージ: dextractor (1.0-6)
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メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
(d)extractor and compression command library
Dextractor commands allow one to pull exactly and only the information needed for assembly and reconstruction from the source HDF5 files produced by the PacBio RS II sequencer, or from the source BAM files produced by the PacBio Sequel sequencer.
For each of the three extracted file types -- fasta, quiva, and arrow -- the library contains commands to compress the given file type, and to decompress it, which is a reversible process delivering the original uncompressed file. The compressed .fasta files, with the extension .dexta, consume 1/4 byte per base. The compressed .quiva files, with the extension .dexqv, consume 1.5 bytes per base on average, and the compressed .arrow files, with the extension .dexar, consume 1/4 byte per base
For more information, please view the available documentation at https://github.com/thegenemyers/DEXTRACTOR
その他の dextractor 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libhdf5-103-1
- HDF5 C runtime files - serial version
dextractor のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 48.7 kB | 289.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 42.5 kB | 353.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 43.3 kB | 348.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 42.2 kB | 348.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 46.6 kB | 320.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 42.2 kB | 288.0 kB | [ファイル一覧] |
| mipsel | 45.4 kB | 312.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 48.7 kB | 417.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 46.2 kB | 305.0 kB | [ファイル一覧] |