パッケージ: density-fitness (1.0.8-4)

[ ソース: density-fitness  ]

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

その他の density-fitness 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libcifpp5 (>= 5.0.7.1)

  Library files for libcifpp

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libpdb-redo3 (>= 3.0.5)

  Library file for libpdb-redo

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8)

  Library file for libzeep

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.2)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

density-fitness のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	448.0 kB	5,548.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	443.8 kB	5,544.0 kB	[ファイル一覧]
armel	442.7 kB	5,531.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	443.1 kB	5,503.0 kB	[ファイル一覧]
i386	452.0 kB	5,554.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	447.9 kB	5,615.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	447.8 kB	5,613.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	449.9 kB	5,608.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	444.2 kB	5,556.0 kB	[ファイル一覧]