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パッケージ: beagle (220722-1)

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Genotype calling, genotype phasing and imputation of ungenotyped markers

Beagle performs genotype calling, genotype phasing, imputation of ungenotyped markers, and identity-by-descent segment detection. Genotypic imputation works on phased haplotypes using a Li and Stephens haplotype frequency model. Beagle also implements the Refined IBD algorithm for detecting homozygosity-by-descent (HBD) and identity-by-descent (IBD) segments.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::java, interface::commandline, 役割: プログラム, 目的: 解析

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