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パッケージ: hmmer2 (2.3.2+dfsg-8)

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タンパク質配列解析用のプロファイル隠れマルコフモデル

HMMER は、プロファイル隠れマルコフモデル法の実装であり、多重配列アライメン トをクエリー (問い合わせ) として用いた生物学配列データベースの感度の高い検 索を行うためのものです。

入力として多重配列アライメントを与えると、HMMER は "隠れマルコフモデル" と 呼ばれる統計モデルを構築します。このモデルをさらにクエリーとして、配列デー タベースから、配列ファミリの追加のホモログ (相同体) を検索する (またはアラ イメントする) ことができます。

その他の hmmer2 関連パッケージ

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