Source Package: roary (3.13.0+dfsg-1)
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Maintainers:
External Resources:
The following binary packages are built from this source package:
- roary
- catena di strumenti autonoma ad alta velocità per pan-genomi
Other Packages Related to roary
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- adep:
debhelper
(>= 12~)
- programmi ausiliari per debian/rules
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- adep:
dh-dist-zilla
- aggiunta a debhelper per chiamare dzil build e fare pulizia dopo la creazione
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- adep:
libdist-zilla-plugin-podweaver-perl
- Dist::Zilla plugin to use Pod::Weaver to generate Pod documentation
-
- adep:
bioperl
(>= 1.7.4)
- strumenti Perl per biologia molecolare computazionale
-
- adep:
libarray-utils-perl
- raccolta di piccole utilità per manipolazione di array
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- adep:
libenv-path-perl
- modulo Perl che implementa operazioni avanzate su variabili di percorso
-
- adep:
libexception-class-perl
- modulo per dichiarare delle vere classi d'eccezione in Perl
-
- adep:
libfile-find-rule-perl
- modulo per cercare file in base a regole
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- adep:
libfile-grep-perl
- modulo per corrispondenza a modelli in una serie di file
-
- adep:
libfile-slurper-perl
- simple, sane and efficient module to slurp a file
-
- adep:
libfile-which-perl
- modulo Perl per cercare programmi eseguibili nel PATH
-
- adep:
libfindbin-libs-perl
- Perl module to use a relative path for lib directories
-
- adep:
libgraph-perl
- Perl module for graph data structures and algorithms
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- adep:
libgraph-readwrite-perl
- module for reading and writing directed graphs
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- adep:
liblog-log4perl-perl
- port in Perl dell'ampiamente popolare pacchetto di log log4j
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- adep:
libmoose-perl
- moderna infrastruttura per sistema ad oggetti Perl
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- adep:
libperlio-utf8-strict-perl
- fast and correct UTF-8 Perl IO module
-
- adep:
libtest-most-perl
- Perl module with the most commonly needed test functions and features
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- adep:
libtest-file-perl
- modulo Perl per testare attributi di file
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- adep:
libtest-files-perl
- modulo per facilitare i test con file e directory
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- adep:
libtest-output-perl
- perl module to test stdout and stderr messages
-
- adep:
libtext-csv-perl
- manipolatore di valori separati da virgole (tramite XS o PurePerl)
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- adep:
bedtools
- suite di utilità per confrontare tratti genomici
-
- adep:
cd-hit
- suite di programmi progettati per raggruppare velocemente sequenze
-
- adep:
ncbi-blast+
- suite di prossima generazione degli strumenti di ricerca di sequenze BLAST
-
- adep:
mcl
- algoritmo Cluster di Markov
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- adep:
parallel
- crea ed esegue righe di comando dallo standard input in parallelo
-
- adep:
prank
- kit per allineamenti probabilistici di sequenze di DNA, codoni e amminoacidi
-
- adep:
r-base-core
- nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R
-
- adep:
mafft
- programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche
-
- adep:
fasttree
- phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
-
- idep:
perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall