Package: pigx-rnaseq (0.0.10+ds-2)

[ Source: pigx-rnaseq  ]

pipeline for checkpointed and distributed RNA-seq analyses

This package provides a automated workflow for the automated analysis of RNA-seq experiments. A series of well-accecpted tools are connected in Python scripts and controlled via snakemake. This supports the parallel execution of these workflows and provides checkpointing, such that interrupted workflows can take up their work again.

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