Package: r-bioc-genomicfiles (1.34.0-1)

[ Source: r-bioc-genomicfiles  ]

Distributed computing by file or by range

This package provides infrastructure for parallel computations distributed 'by file' or 'by range'. User defined MAPPER and REDUCER functions provide added flexibility for data combination and manipulation.

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• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

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  funzioni generiche per Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.1.0)

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• dep: r-bioc-genomeinfodb

  utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.7.7)

  rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.16)

  rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

• dep: r-bioc-iranges

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• dep: r-bioc-matrixgenerics

  funzioni S4 per statistiche riassuntive generiche che operano su oggetti stile matrice

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.17.29)

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.25.3)

  interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.9.25)

  implementazione di vettori e liste per BioConductor S4

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  contenitore per saggi BioConductor

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.27.9)

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• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biostrings

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• sug: r-bioc-genefilter

  metodi per filtrare geni da esperimenti con microarray

• sug: r-bioc-snpstats

  classi e metodi SnpMatrix e XSnpMatrix per BioConductor

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

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