Package: r-bioc-ggbio (1.46.0-1)

[ Source: r-bioc-ggbio  ]

Visualization tools for genomic data

The ggbio package extends and specializes the grammar of graphics for biological data. The graphics are designed to answer common scientific questions, in particular those often asked of high throughput genomics data. All core Bioconductor data structures are supported, where appropriate. The package supports detailed views of particular genomic regions, as well as genome-wide overviews. Supported overviews include ideograms and grand linear views. High-level plots include sequence fragment length, edge-linked interval to data view, mismatch pileup, and several splicing summaries.

Other Packages Related to r-bioc-ggbio

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  GNU R Annotation Database Interface per BioConductor

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  funzionalità per filtrare risorse di annotazioni per Bioconductor

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  utilità grafiche di base per GNU R per la visualizzazione di dati genomici

• dep: r-bioc-bsgenome

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• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.1.16)

  rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

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• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.25.16)

  interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.13)

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• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.11.4)

  annotazione di varianti genetiche per BioConductor

• dep: r-cran-ggally

  GNU R extension to r-cran-ggplot2

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 1.0.0)

  implementazione di Grammar of Graphics

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• dep: r-cran-hmisc

  funzioni miste di Frank Harrell per GNU R

• dep: r-cran-reshape2

  riorganizza in modo flessibile i dati: nuova reimplementazione del pacchetto reshape

• dep: r-cran-rlang

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• dep: r-cran-scales

  funzioni di scalatura per la visualizzazione

• rec: r-cran-testthat

  suite di test di GNU R

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-tinytex

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