Paquet : thesias (3.1.1-3)

[ Paquet source : thesias  ]

test des effets d’haplotypes dans les études d’associations

L’objectif du programme THESIAS est de réaliser des analyses d’association basées sur les haplotypes d’individus non apparentés. Ce programme est basé sur le modèle de maximum de vraisemblance décrit dans Trégouët et al. 2002 (Hum Mol Genet 2002,11 : p. 2015-2023) et est lié à l’algorithme SEM (Trégouët et al. Ann Hum Genet 2004,68 : p. 165-177). THESIAS permet d’estimer simultanément les fréquences d’haplotypes et leurs effets associés sur le phénotype étudié. Dans cette nouvelle version de THESIAS, les résultats quantitatifs, qualitatifs (analyse de comparaison par paires et logistique), catégoriels et de survie peuvent être étudiés. L’analyse d’haplotypes X est aussi réalisable. Les effets d’haplotypes en fonction de la covariance ainsi que les interactions entre haplotypes et covariance peuvent être étudiées.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, implemented-in::java, Interface utilisateur: Ligne de commande, interface::graphical, interface::x11, Rôle: Programme, But: Analyse, Système X Window: Application

Autres paquets associés à thesias

• dep: default-jre

  environnement d'exécution Java standard ou compatible

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.34) [armel, armhf]

  dep: libc6 (>= 2.7) [i386, mips64el, s390x]

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	175,7 ko	339,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	164,5 ko	367,0 ko	[liste des fichiers]
armel	172,8 ko	359,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	162,9 ko	267,0 ko	[liste des fichiers]
i386	173,9 ko	355,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	160,8 ko	371,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	173,1 ko	431,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	173,1 ko	287,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	196,7 ko	395,0 ko	[liste des fichiers]