Paquet : ggd-utils (1.0.0+ds-1 et autres)

[ Paquet source : ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Autres paquets associés à ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
s390x	1.0.0+ds-1+b12	1 922,3 ko	6 523,0 ko	[liste des fichiers]