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Paquet : clonalorigin (1.0-8 et autres)

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inférence de recombinaison homologue dans les bactéries grâce à des séquences de génomes entiers

Contrairement à nous, les bactéries peuvent se reproduire elles-mêmes. Elles ont néanmoins des mécanismes qui transfèrent l’ADN entre les organismes, un processus plus formellement appelé recombinaison. Les mécanismes dans lesquels la recombinaison a lieu ont été très étudiés en laboratoire mais il reste encore à comprendre comment, quand et où se produit la recombinaison dans les populations naturelles de bactéries et comment cela les aide à s’adapter à de nouveaux environnements. ClonalOrigin réalise une analyse comparée des séquences d’un échantillon de génomes bactériens afin de reconstruire les événements de recombinaison qui ont eu lieu chez leurs ancêtres.

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