Paquet : bwa (0.7.18-1)
Liens pour bwa
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bwa :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
- Carlos Borroto (Page QA)
- Ognyan Kulev (Page QA)
- Michael R. Crusoe (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [bio-bwa.sourceforge.net]
Paquets similaires :
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
Autres paquets associés à bwa
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- rec: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- sug: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
Télécharger bwa
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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s390x | 222,8 ko | 511,0 ko | [liste des fichiers] |