Paquet : poa (2.0+20060928-9)

[ Paquet source : poa  ]

alignement d'ordre partiel pour les alignements multiples de séquences

POA signifie Alignement d'Ordre Partiel (Partial Order Aligment en anglais). C'est un programme rapide de MSA (alignement multiple de séquences) en bio-informatique. Ses points forts sont la vitesse, la déployabilité, la sensibilité et son aptitude supérieure à gérer les branchements et les indels dans l'alignement. L'alignement d'ordre partiel est une approche pour MSA qui peut être combinée avec d'autres méthodes comme l'alignement progressif. POA aligne de manière optimale une paire de MSA et peut donc être utilisé directement avec des méthodes progressives comme CLUSTAL. Pour les alignements de grande taille, POA est de dix à trente fois plus rapide que CLUSTALW.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: scope::utility, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à poa

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• sug: blast2

  Paquet indisponible

• enh: t-coffee

  alignement multiple de séquences

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
riscv64	51,9 ko	122,0 ko	[liste des fichiers]