Paquet : r-bioc-scuttle (1.14.0+dfsg-1)

[ Paquet source : r-bioc-scuttle  ]

BioConductor single-cell RNA-Seq analysis utilities

Provides basic utility functions for performing single-cell analyses, focusing on simple normalization, quality control and data transformations. Also provides some helper functions to assist development of other packages.

Autres paquets associés à r-bioc-scuttle

• dep: libc6 (>= 2.11) [mips64el, s390x]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non riscv64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

• dep: liblapack3

  bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

  ou liblapack.so.3

  paquet virtuel fourni par liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-beachmat (>= 2.20.0)

  E/S pour plusieurs formats de stockage de données de matrice

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.30.1)

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats (>= 1.26.0)

  fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-singlecellexperiment (>= 1.26.0)

  S4 Classes for Single Cell Data

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor assay container

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-scran (>= 1.32.0)

  méthodes de BioConductor pour l’analyse de données de séquençage d’ARN de cellule unique

• sug: r-bioc-scrnaseq (>= 2.18.0)

  Paquet indisponible

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Télécharger r-bioc-scuttle

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	434,3 ko	803,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	419,7 ko	804,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	417,6 ko	911,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	429,7 ko	867,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	430,6 ko	739,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	434,0 ko	827,0 ko	[liste des fichiers]