Paquet : psortb (3.0.6+dfsg-4 et autres)

[ Paquet source : psortb  ]

outil de prédiction de localisation bactérienne

PSORTb permet la prédiction de localisation sub-cellulaire (SCL) de protéines de bactérie et fournit des moyens rapides et peu couteux pour obtenir une vue dans la fonction de protéine, la vérification de résultats expérimentaux, l’annotation de génomes de bactérie nouvellement séquencés, la détection de cibles de médicament potentielles de sécrétion ou de membrane plasmique, ainsi que l’identification de biomarqueurs pour des microbes.

Autres paquets associés à psortb

• dep: libalgorithm-svm-perl

  liaisons pour la bibliothèque libsvm de machine à vecteurs de support

• dep: libbio-perl-perl

  modules Perl principaux de BioPerl

• dep: libbio-perl-run-perl

  modules d'enveloppe BioPerl

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libmodhmm0 (>= 1.0+dfsg)

  library for constructing, training and scoring hidden Markov models

• dep: librpc-xml-perl

  Perl implementation of the XML-RPC protocol

• dep: libsquid1t64 (>= 1.9g+cvs20050121)

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libsvmloc0 (>= 1.0+dfsg)

  PSORTb adapted library for svm machine-learning library

• dep: perl (>= 5.40.0-8)

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• dep: perlapi-5.40.0

  paquet virtuel fourni par perl-base

• dep: pftools

  construction et recherche de profils généralisés de protéine et d’ADN

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	3.0.6+dfsg-4+b2	15 985,4 ko	116 751,0 ko	[liste des fichiers]