Paquet : r-bioc-mofa (1.6.1+dfsg-13)

[ Paquet source : r-bioc-mofa  ]

MOFA (Multi-Omics Factor Analysis)

Multi-Omics Factor Analysis : cadriciel non entretenu pour l’intégration d’ensembles de données de multiomique.

L’amont n’entretient plus ce paquet. Celui-ci est encore fourni comme aide lors de nouvelles exécutions, de comparaisons ou de transitions de projets existants. Pour de nouveaux projets, une mise à niveau vers MOFA2 (MOFA+) est recommandé. En fait, lors de l’ajout de nouvelles données à d’anciens projets, MOFA2 a en outre amélioré la gestion de facteurs multiples et pour compenser l’effet de lots qui est vraisemblablement introduit avec les données supplémentaires, peut être un cas d’utilisation immédiate de cette nouvelle version.

Autres paquets associés à r-bioc-mofa

• dep: python3-mofapy

  Multi-Omics Factor Analysis (MOFA) - Python module

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase

  fonctions de base pour Bioconductor

• dep: r-bioc-multiassayexperiment

  Software for integrating multi-omics experiments in BioConductor

• dep: r-bioc-rhdf5

  BioConductor HDF5 interface to R

• dep: r-cran-corrplot

  visualisation d’une matrice de corrélation

• dep: r-cran-cowplot

  GNU R streamlined plot theme and plot annotations for 'ggplot2'

• dep: r-cran-doparallel

  GNU R foreach parallel adaptor for the parallel package

• dep: r-cran-dplyr

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-foreach

  GNU R foreach looping support

• dep: r-cran-ggally

  GNU R extension to r-cran-ggplot2

• dep: r-cran-ggbeeswarm

  tracé (diagramme en violon) de dispersion de points par catégorie avec GNU R

• dep: r-cran-ggplot2

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-ggrepel

  auto-position non-overlapping text labels in plots

• dep: r-cran-pheatmap

  GNU R package to create pretty heatmaps

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

• dep: r-cran-reshape2

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• dep: r-cran-reticulate

  R interface to Python modules, classes, and functions

• dep: r-cran-scales

  Scale functions for visualization

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	567,5 ko	777,0 ko	[liste des fichiers]