Paquet : poretools (0.6.0+dfsg-7)

[ Paquet source : poretools  ]

toolkit for nanopore nucleotide sequencing data

poretools is a flexible toolkit for exploring datasets generated by nanopore sequencing devices from MinION for the purposes of quality control and downstream analysis. Poretools operates directly on the native FAST5 (a variant of the HDF5 standard) file format produced by ONT and provides a wealth of format conversion utilities and data exploration and visualization tools.

Autres paquets associés à poretools

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-h5py (>= 2.2.0)

  interface généraliste de Python pour hdf5

• dep: python3-matplotlib

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab

• dep: python3-pandas

  structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »

• dep: python3-seaborn

  bibliothèque de visualisation de statistiques pour Python 3

Télécharger poretools

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	19,3 ko	116,0 ko	[liste des fichiers]