Paquet : plink1.9 (1.90~b7.2-231211-1)

[ Paquet source : plink1.9  ]

outils d'analyse d'associations sur le génome entier

Plink traite les données provenant de fragments SNP (single nucleotide polymorphism — polymorphisme d'un seul nucléotide) de nombreux individus et leur description d'un phénotype pathologique. Il trouve les associations entre un phénotype et les variations d'ADN simple ou double brin et il peut récupérer les annotations SNP depuis une ressource en ligne.

Les SNP peuvent être analysés individuellement ou en tant que paires pour leur association avec les phénotypes pathologiques. L'étude conjointe des variations du nombre de copies est prise en charge. Divers tests statistiques ont été implémentés.

Plink1.9 est une mise à jour complète de plink avec de nouveaux algorithmes et de nouvelles méthodes et une utilisation de la mémoire plus faible et rapide que le premier plink.

Il est à noter que l'exécutable a été renommé en plink1.9 en raison d'un conflit de noms. Consulter /usr/share/doc/plink1.9/README.Debian pour plus d'informations.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, But: Analyse

Autres paquets associés à plink1.9

• dep: libblas3

  implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

  ou libblas.so.3

  paquet virtuel fourni par libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: liblapack3

  bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

  ou liblapack.so.3

  paquet virtuel fourni par liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: libopenblas0

  Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)

  ou libblis4

  BLAS-like Library Instantiation Software Framework (32bit,meta)

Télécharger plink1.9

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	875,0 ko	2 134,0 ko	[liste des fichiers]
armel	783,1 ko	2 061,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	765,4 ko	1 449,0 ko	[liste des fichiers]
i386	881,9 ko	2 377,0 ko	[liste des fichiers]