Paquet : assemblytics (1.2.1+dfsg-2)

[ Paquet source : assemblytics  ]

détection et analyse de variantes structurelles à partir d’un assemblage de génome

Assemblytics incorpore une approche unique de filtrage d’ancre pour augmenter la robustesse d’éléments répétitifs et identifie six classes de variantes basées sur leurs signatures d’alignements distincts. Assemblytics peut être appliqué pour comparer des génomes aberrants, comme les cancers humains, à des références, ou pour identifier des différences entre des espèces proches.

Autres paquets associés à assemblytics

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  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

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  gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3

• dep: r-base-core

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

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  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

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  Alignement de séquence efficace de génomes complets

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	18,2 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]