Paquet : loki (2.4.7.4-12)

[ Paquet source : loki  ]

analyse de déséquilibre de liaison avec des chaînes de Markov

Ce programme opère une analyse de liaison multipoint par une méthode utilisant des chaînes de Markov Monte Carlo (MCMC) sur des généalogies complexes et de grande taille. Pour le moment, le paquet ne propose que l'analyse de caractères quantitatifs, mais cette restriction sera levée dans une version future. L'estimation combinée du nombre de QTL (Quantitative Trait Loci), de leur position et de leurs effets est faite par un saut réversible MCMC (RJMCMC). Il est aussi possible de faire des analyses de type « affected only IBD (Identity By Descent) sharing ».

Étiquettes: Domaine: Biologie, Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: interface::commandline, role::program, Champ d'application: Utilitaire, But: Étiquette supplémentaire nécessaire, use::analysing, works-with-format::TODO, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à loki

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• sug: loki-doc

  MCMC linkage analysis on general pedigrees (PS manual)

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	363,3 ko	934,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	326,9 ko	998,0 ko	[liste des fichiers]
armel	335,2 ko	1 058,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	334,9 ko	866,0 ko	[liste des fichiers]
i386	357,6 ko	978,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	342,3 ko	1 086,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	368,7 ko	1 190,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	357,4 ko	738,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	401,5 ko	1 014,0 ko	[liste des fichiers]