Paquet : bandage-examples (0.9.0-2)
Liens pour bandage-examples
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bandage :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Cédric Lood (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [rrwick.github.io]
Paquets similaires :
application de bio-informatique pour navigation simple dans les graphes d’assemblage De novo – données
Bandage est un programme graphique permettant aux utilisateurs d’interagir avec les graphes d’assemblage réalisés par les assembleurs de novo tels que Velvet, SPAdes, MEGAHIT et d’autres.
Les graphes d’assemblage de novo contiennent non seulement les contigs assemblés, mais aussi les connexions entre ceux-ci, qui n’étaient auparavant pas faciles d’accès. Bandage visualise les graphes d’assemblage, avec les connexions, grâce à des algorithmes d’agencement de graphes. Les nœuds du graphe dessiné, qui représentent les contigs, peuvent être étiquetés automatiquement avec leur identifiant, leur longueur ou leur profondeur. Les utilisateurs peuvent interagir avec le graphe en déplaçant, étiquetant ou colorant les nœuds. L’information de séquence peut aussi être directement extraite du visionneur de graphe. En représentant les connexions entre contigs, Bandage ouvre de nouvelles possibilités d’analyse et d’amélioration des assemblages de novo qui n’étaient pas possibles en observant les contigs seuls.
Le site web de Bandage propose davantage d’informations et de liens de téléchargement : rrwick.github.io/Bandage.
Ce paquet fournit quelques exemples de données.
Autres paquets associés à bandage-examples
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- enh: bandage
- application de bio-informatique pour navigation simple dans les graphes d’assemblage De novo
Télécharger bandage-examples
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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all | 3 051,2 ko | 3 069,0 ko | [liste des fichiers] |