Paquet : gromacs (2024.3-2)

[ Paquet source : gromacs  ]

Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

GROMACS est un paquet polyvalent pour faire de la dynamique moléculaire, comme la simulation d'équations newtoniennes du mouvement de systèmes de millions de particules.

Il a été créé en premier lieu pour les molécules biochimiques comme les protéines et les lipides qui ont beaucoup d'interactions covalentes compliquées, mais comme GROMACS est extrêmement rapide pour calculer les interactions non covalentes (qui souvent dominent les simulations), beaucoup de groupes l'utilisent aussi pour la recherche sur des systèmes non biologiques, comme les polymères.

Ce paquet fournit des variantes pour l’exécution sur une seule machine et pour utiliser l’interface MPI sur plusieurs machines.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Biologie structurale, field::chemistry, implemented-in::c, Interface utilisateur: Ligne de commande, interface::graphical, interface::x11, Rôle: Programme, Boîte à outils d'interface utilisateur: Bibliothèque X, Système X Window: Application

Autres paquets associés à gromacs

• dep: gromacs-data (= 2024.3-2)

  simulateur de dynamique moléculaire GROMACS – données et documentation

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgromacs9 (>= 2024.3)

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: sse4.2-support [amd64]

  CPU feature checking - require SSE4.2

• rec: cpp

  préprocesseur C GNU (cpp)

• rec: mpi-default-bin

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• sug: pymol

  système de graphismes moléculaires

Télécharger gromacs

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	59,9 ko	461,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	60,2 ko	589,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	60,3 ko	601,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	61,6 ko	589,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	61,7 ko	397,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	57,1 ko	413,0 ko	[liste des fichiers]