[ Paquet source : libssw ]
Paquet : ssw-align (1.1-15 et autres)
Liens pour ssw-align
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source libssw :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Sascha Steinbiss (Page QA)
- Michael R. Crusoe (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
aligneur Smith-Waterman basé sur libssw
Ce paquet fournit un logiciel d’alignement en ligne de commande basé sur la bibliothèque libssw, une implémentation SIMD (Single Instruction on Multiple Data) accéléré de l’algorithme Smith-Waterman. Les fichiers d’entrée peuvent être aux formats FASTA ou FASTQ. À la fois les fichiers de cible et de requête peuvent contenir plusieurs séquences. Chaque séquence dans le fichier de requête sera alignée avec toutes les séquences dans le fichier de cible. La sortie est fournie au format texte de type SAM ou BLAST.
Autres paquets associés à ssw-align
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libssw0 (= 1.1-15+b1)
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger ssw-align
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| armel | 1.1-15+b1 | 24,1 ko | 63,0 ko | [liste des fichiers] |