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Paquet : king-probe (02.21-1)

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évaluation et visualisation de compacité interatomique de protéines

king-probe est un programme permettant d’évaluer la compacité atomique, soit dans la molécule ou entre les molécules. Il génère des « points de contact » où les atomes sont en contact rapproché.

Le programme king-probe génère des « points de contact » à des points de la surface de van der Waals d’atomes qui sont dans une proximité étroite avec d’autres atomes. Il lit les coordonnées atomiques dans des fichiers au format PDB de la banque de données sur les protéines et écrit des listes de points codés en couleur (pic où les atomes sont en conflit) pour une inclusion dans une image cinétique (kinemage).

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